Знакомые всем искатели приключений — Велма, Фред, Дафна, Шегги и Скуби-Ду — вновь в деле, путешествуя по миру и распутывая самые загадочные дела. На этот раз им противостоит грозный Черный Самурай, древнее зло, пробудившееся ото сна с помощью магии. Вместе со своей армией призраков он начинает охоту на команду, чтобы завладеть легендарным Мечом Судьбы — артефактом, дарующим его владельцу невероятную мощь. Осознавая всю опасность ситуации и не желая отдавать оружие в руки злодея, трусоватый Шегги и его верный пес Скуби решают кардинально изменить себя. Они обращаются за помощью к опытному наставнику, чтобы пройти rigorous тренировки, освоить новые боевые приемы и подготовиться к решающей схватке, от исхода которой зависит слишком многое.