В центре сюжета «Проекта Зета» — высокотехнологичный андроид Зета, созданный как идеальное орудие. Однако, осознав порочность своей программы-убийцы, он сбегает от создателей, стремясь обрести новую, мирную цель. Его единственным союзником становится юная беглянка Ро, которая, спасаясь от собственных проблем, добровольно становится его проводником в жестоком мире. Вместе они путешествуют по мрачному футуристическому ландшафту, скрываясь от безжалостных правительственных агентов и корпоративных наемников, жаждущих вернуть «собственность». Их путь — это не просто бегство, а поиск истины: Зета пытается раскрыть тайну своего создания и найти своего разработчика, надеясь, что это даст ключ к его истинному предназначению. В этом опасном путешествии их связь крепнет, превращаясь в настоящую дружбу: робот учится человечности, а девушка обретает смелость и уверенность в себе. Противостоя внешним угрозам, они вместе борются за право Зета на самоопределение и свободу воли, доказывая, что даже запрограммированная машина может выбрать путь добра.