Застенчивый и чрезмерно опекающий отец-клоун Марлин, живущий в безопасности Австралийского Барьерного рифа, в одночасье сталкивается с кошмаром всех родителей: его единственный сын Немо похищен дайверами. Несмотря на собственные страхи и сомнения, Марлин бросается в бескрайний и пугающий океан. Его единственной спутницей становится непредсказуемая королевский хирург Дори, чья доброта компенсирует лишь её кратковременную память. Их путь пролегает через мрачные глубины, полные акул, смертоносные медузы и стремительное Восточно-Австралийское течение. Параллельно сам Немо, оказавшись в аквариуме стоматологического кабинета в Сиднее, проявляет неожиданную смекалку, объединившись с «Бандой аквариума», чтобы разработать дерзкий план побега. Обе истории переплетаются, демонстрируя удивительную храбрость: Марлин учится отпускать страх и доверять сыну, а Немо доказывает, что даже маленькая рыбка способна на большое мужество. В итоге их невероятное путешествие, полное юмора, опасностей и трогательных встреч, заканчивается воссоединением, которое доказывает, что настоящая любовь способна преодолеть любые, даже самые грандиозные, расстояния.